El objetivo central fue identificar relaciones entre el foco emocional y los juicios metacognitivos, en un proceso de formación de docentes. Para ello se desarrolló un processo metodológico con enfoque descriptivo - interpretativo, apoyado en la investigación basada en el diseño. Los participantes, 25 docentes en formación adscritos a un programa de licenciatura en ciencias naturales, diligenciaron un cuestionario antes y después de un proceso formativo proyectado a la enseñanza y el aprendizaje de la argumentación en clase de ciencias. El proceso tuvo una duración de 16 semanas, correspondiente a un semestre académico para el desarrollo del proceso formativo en la asignatura: Didáctica de la Biología. En términos de resultados, la incongruencia cognitiva y la atención a la actividad, son focos objeto activadores de las emociones y, por tanto, vínculo relacional de las emociones epistémicas y de logro con juicios metacognitivos. Se sugiere trabajar de manera conjunta estas dimensiones para poder comprender en profundidad la gestión emocional en procesos de educación formal.