Transferibilidade de locos microssatélites desenvolvidos em outras espécies de palmeiras para Astrocaryum vulgare Mart.
Revista de Ciências Agrárias Amazonian Journal of Agricultural and Environmental Sciences
Transferibilidade de locos microssatélites desenvolvidos em outras espécies de palmeiras para Astrocaryum vulgare Mart.
Autor Correspondente: Maria do Socorro Padilha de Oliveira | [email protected]
Palavras-chave: Amplificação, Polimorfismo, SSR, Tucumã-do-Pará, Amplification, Polymorphism, Fiber Palm-of-Pará
Resumos Cadastrados
Resumo Português:
Astrocaryum vulgare Mart., conhecida por tucumã-do-Pará, possui uso popular na região amazônica e grandes potencialidades de aproveitamento em indústrias farmacêutica, cosmética e de biodiesel. A exploração ainda é extrativista, tornando fundamentais informações sobre a variabilidade genética existente em áreas de ocorrência natural. A variabilidade genética pode ser acessada por marcadores microssatélites ou SSR, considerados ideais para estudo em populações naturais. Entretanto, não há relatos de desenvolvimento de microssatélites para A. vulgare. O objetivo foi avaliar a transferibilidade de locos SSR desenvolvidos para outras espécies de palmeiras em A. vulgare. Realizou-se a extração de DNA a partir de amostras de folíolos de tucumanzeiros de sete povoamentos e após a quantificação os DNA’s foram submetidos à PCR, com os locos desenvolvidos para Bactris gasipaes, Phoenix dactylifera e Astrocaryum aculeatum. As condições de amplificação seguiram o protocolo desenvolvido para A. aculeatum, com pequenas adaptações. Os produtos amplificados foram aplicados em gel de agarose a 3,5%, corado com brometo de etídio e submetidos à eletroforese horizontal. Os perfis dos géis foram fotodocumentados e as imagens armazenadas digitalmente. A transferibilidade dos locos foi avaliada com base na amplificação dos produtos, sua nitidez e ausência de bandas inespecíficas. Todos os locos de A. aculeatum e a maioria dos de B. gasipaes amplificaram, com 75% deles transferíveis para o genoma de A. vulgare, enquanto que apenas dois dos locos de P. dactylifera amplificaram, com muitas bandas inespecíficas, mostrando-se inviáveis para estudos do genoma da espécie.
Resumo Inglês:
Astrocaryum vulgare Mart., known as “tucumã-do-Pará”, has popular use in the Amazon region and large exploitation potential in pharmaceutical, cosmetics and biodiesel industries. Considering that its exploitation is not commercial yet, the information about the genetic variability of populations in natural occurrence areas is of fundamental importance. Genetic variability may be accessed by microsatellite or SSR markers, considered ideal for studies in natural populations. However, there are no reports of microsatellites development to A. vulgare. The aim of this study was to evaluate the transferability of SSR loci developed for other palm species to A. vulgare. DNA extraction was performed from A. vulgare leaflet samples from seven natural stands and, after quantification, the DNAs were subjected to PCR with the loci developed to Bactris gasipaes, Phoenix dactylifera and Astrocaryum aculeatum. Amplification conditions followed the protocol developed for A. aculeatum, with minor adaptations. The amplified products were applied to agarose gel 3.5%, stained with ethidium bromide and subjected to horizontal electrophoresis. Profiles of the gels were photodocumented and the images were digitally stored. The transferability of locos was evaluated with basis on the amplification of the products, their sharpness and lack of nonspecific bands. All loci for A. aculeatum and most for B. gasipaes were amplified and 75% of them proved to be useful to access the genome of A. vulgare, while only two loci of P. dactylifera were amplified, with many nonspecific bands, showing to be infeasible for studies of the genome of that species.
