An in silicodata miningof theammonium transporter gene familyin Ananas comosus L.

Ano: 2020 | Volume: 16 | Número: 6

Autores: Renato Marcos de Leão, Silvia Graciele Hülse de Souza, Tiago Benedito dos Santos

Palavras-chave: análise bioinformática;abacaxi;amônio;transporte de nitrogênio

Resumo Português:

Indiscutivelmente, o nitrogênio (N) é um componente importante e essencial para o crescimento e desenvolvimento das plantas. Oamônio é a principal fonte de nitrogênio inorgânico para as plantas, sendo mobilizado pelo transportador de amônio (AMT), dentre as fontes de N disponíveis. Neste estudo, a mineração de dados revelou que no genoma de Ananas comosusL. foram identificados oito genes da família AMT.As oito proteínas AcoAMT de abacaxi foram identificadas e filogeneticamente agrupadas em dois grupos com proteínas AMT de outras plantas. Dois pares de genes AcoAMT(AcoAMTae AcoAMTg) localizados no cromossomo 1 e não cromossômicos parecem ser duplicações segmentares.Com base nessas informações, realizamos uma análise abrangente usando algumasferramentasdebionformática com a finalidadede caracterizar individualmente os genes identificados. A análise abrangente do AMT fornecerá uma base importante para uma investigação mais aprofundada dos mecanismos regulatórios de AcoAMTs em A. comosusL.

Resumo Inglês:

Arguably, nitrogen (N) is an important and essential component for plant growth and development. Ammonium is a major inorganic nitrogen source for plants mobilized by ammonium transporter (AMT) among N available sources. In this study, data mining revealed that in theAnanas comosusL. genome was identified eight AMT family genes. The eight pineapple AcoAMT proteins were identified and phylogenetically clustered into two groups with AMT proteins from other plants. Two pairs ofAcoAMT(AcoAMTaandAcoAMTg) genes located on chromosome 1 and unchromosome appear to be segmental duplications. Based on this information, we conducted a comprehensive analysis using some bioinformatics tools to characterize the identified genes individually. The comprehensive analysis of AMT will provide an essential foundation for further investigation of the regulatory mechanisms ofAcoAMTsinA. comosusL