Identification of some Amazonian species of Culex (Culex) and Culex (Melanoconion) by morphotyping and barcoding
Acta Brasiliensis
Identification of some Amazonian species of Culex (Culex) and Culex (Melanoconion) by morphotyping and barcoding
Autor Correspondente: Cícera Alexsandra Costa dos Santos | [email protected]
Palavras-chave: ABGD, coI gene, HP trap, Neighbor-Joining method, Taxonomic Diagnosis
Resumos Cadastrados
Resumo Português:
Os mosquitos Culex spp. apresentam características idiossincráticas e sua baixa variabilidade dificulta sua identificação. O objetivo do nosso estudo foi analisar a região 5 'do gene da subunidade I do citocromo oxidase (coI) para a identificação taxonômica de espécies de Culex que foram previamente diagnosticadas em subgêneros Culex e Melanoconion em condições de campo. Dez sequências de espécimes foram analisadas pelo Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). Todas as sequências apresentaram 94-99% de identidade quando comparadas com outras sequências de espécies de Culex disponíveis no GenBank. Cinco partições iniciais suportaram 80-88 grupos de espécies. Entre eles, oito conjuntos continham os espécimes do presente estudo. Das 10 sequências de mosquitos, cinco não formaram nenhum cluster consistente, e as demais apresentaram alguma consistência no diagnóstico taxonômico nas condições de campo. Nossos resultados sugerem que algumas sequências do gene coI de espécimes podem pertencer a espécies do subgênero Melanoconion, cuja sequência 5' coI é desconhecida ou inédita no GenBank.
Resumo Inglês:
Culex spp. mosquitoes have idiosyncratic characteristics and its low variability makes difficult their identification. The aim of our study was to analyze the 5' region of the cytochrome oxidase subunit I gene (coI) for the taxonomic identification of Culex species which were previously morphotyped and diagnosed in Culex and Melanoconion subgenera at the field conditions. Ten specimen sequences were analyzed by the Automatic Barcode Gap Discovery (ABGD). All sequences showed 94-99% identity when compared to other Culex species sequences available from GenBank. Five initial partitions supported 80-88 species groups. Among them, eight sets contained the specimens of the present study. Of the 10 mosquito sequences, five did not form any consistent cluster, and the remaining showed some consistency in the taxonomic diagnosis at the field conditions. Our results suggest that some coI gene sequences of specimens may belong to species of the subgenus Melanoconion, whose 5’ coI sequence is unknown or unpublished in GenBank.
